Poltekkes Kemenkes Gorontalo mencatatkan realisasi anggaran tertinggi pada tahun 2014 sebesar 87,63 persen. Realisasi anggaran ini mengalami penurunan tahun 2015 yang mencapai 82,42 persen dan tahun 2016 mencapai 74,73 persen. Pada tahun 2017 realisasi anggaran ini mengalami kenaikan mencapai 84,46 persen dan pada tahun 2018 realisasi anggaran mencapai 84,99 persen.
